在代謝路徑設計領(lǐng)域，尋找能夠催化非天然反應的候選酶是具有挑戰性的工作。雖然現有一些方法可以根據相似反應識別潛在酶，但在反應類(lèi)型識別和后續酶篩選評估等方面存在不足，難以有效幫助實(shí)驗科學(xué)家快速篩選候選酶進(jìn)行實(shí)驗驗證。近日，中國科學(xué)院天津工業(yè)生物技術(shù)研究所生物設計中心發(fā)布了集成的反應酶挖掘與評估平臺——REME（https://reme.biodesign.ac.cn）。該平臺結合底物原子到產(chǎn)物原子映射、原子類(lèi)型變化識別和反應相似性計算，實(shí)現了相似反應的計算、快速排序和可視化。用戶(hù)可以根據功能基團篩選相似反應，并進(jìn)一步通過(guò)酶號或序列同源性篩選或擴展候選酶。REME平臺結合多種人工智能方法對候選酶進(jìn)行多角度評估，幫助科研人員迅速識別潛在酶。REME平臺為非天然反應的酶挖掘和評估提供了新的解決方案。相關(guān)研究成果發(fā)表在《核酸研究》（Nucleic Acids Research）上。研究工作得到國家自然科學(xué)基金、中國科學(xué)院戰略性先導科技專(zhuān)項、天津市合成生物技術(shù)創(chuàng )新能力提升行動(dòng)專(zhuān)項及合成生物學(xué)海河實(shí)驗室創(chuàng )新基金等的支持。論文鏈接反應酶挖掘與評估平臺